本届青年奥运会场馆分为三大场馆区。分别为集中了主要场馆的“奥体中心区”、以城市人文自然风景为特色的”人文风景区“及位于江宁大学城的“大学城场馆区”。
| 场馆区 | 场景 | 场馆 | 位置 | 项目 |
|---|---|---|---|---|
| 奥体中心区 |  |
南京奥林匹克体育中心 | 建邺区 | 开幕式、 田径、体操、水上运动、现代五项、闭幕式 |
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南京五台山体育中心 | 鼓楼区 | 足球、篮球、乒乓球 | |
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南京国际博览中心 | 建邺区 | 拳击、跆拳道、击剑、现代五项、举重 | |
| 龙江体育馆 | 鼓楼区 | 柔道、摔跤 | ||
| 人文风景区 |  |
玄武湖铁人三项赛场 | 玄武区 | 铁人三项 |
| 南京水上运动学校 | 玄武区 | 皮划艇、赛艇 | ||
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南京体育学院 | 玄武区 | 羽毛球、网球 | |
| 南京国际展览中心 | 玄武区 | 马术 | ||
| 老山国家森林公园 | 浦口区 | 公路自行车 | ||
| 金牛湖帆船赛场 | 六合区 | 帆船 | ||
| 大学场馆区 | 江宁区体育中心 | 江宁区 | 足球、手球 | |
| 方山体育训练基地 | 江宁区 | 射箭、射击 |
